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qPCR实验的注意事项有哪些?

 更新时间:2024-03-06    点击量:1027
  q是指在PCR体系中加入荧光染料或荧光探针,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过C-值和标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。那么你知道qPCR实验的注意事项有哪些吗?让我们一起来看看吧!
 
  一、模板制备
 
  在进行qPCR实验时,需要根据所用试剂盒说明书加入适量的起始核酸模板,过多的模板可能提高污染物含量,大大降低 PCR 效率,过少的模板可能会降低检测灵敏性和重复性。
 
  根据检测靶标的性质特点,选择合适的核酸抽提试剂盒同样至关重要。小编有遇到老师想要通过qPCR的方法完成对microRNA的定量,但是发现待检测样本中目标microRNA和内参基因的扩增曲线出峰时间都比较晚,内参基因的Ct值甚至大于30(图2)。排除实验操作问题后发现原来是因为所使用RNA抽提试剂盒对小片段的microRNA回收效率低,不适合用于下游microRNA定量实验。
 
  二、引物探针的设计及储存
 
  除了要保证模板的质量外,引物探针的设计和稳定性同样至关重要。当我们根据检测靶标设计特异性引物和探针时,除了要考虑片段长度,Tm值,碱基组成等基本要点外,还需格外注意引物,探针自身不能形成复杂的二级结构,上下游引物内部,引物探针之间不能出现结合的现象,因为这些都可能影响引物探针与目标基因的结合,进而影响最终的扩增效率。
 
  除了引物探针在设计时需要格外花费心思外,收到合成好的引物、探针如何稀释,如何保存同样有小tips。如果我们合成的引物探针是干粉状或是需要稀释时,为了保证引物探针的稳定性建议用1×TE buffer去溶解和稀释。另外,引物的储存浓度也可能影响其稳定性,建议引物的储存浓度不低于 10 μM,一般为100 μM 。此外如果引物和探针每次使用量较少时,还应该进行分装,保存在-20℃,以减少反复冻融的次数。
 
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